Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRRC1Q96M27 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms