Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms