Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT74Q96LB3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT74Q96LB3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms