Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG1Q96JA1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms