Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHDQ96IW2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHDQ96IW2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms