Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms