Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APIPQ96GX9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APIPQ96GX9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APIPQ96GX9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APIPQ96GX9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APIPQ96GX9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APIPQ96GX9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APIPQ96GX9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APIPQ96GX9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APIPQ96GX9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms