Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms