Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ULK4Q96C45 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms