Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1AQ96AJ9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTI1AQ96AJ9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms