Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRF1Q92994 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRF1Q92994 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRF1Q92994 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRF1Q92994 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRF1Q92994 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRF1Q92994 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BRF1Q92994 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRF1Q92994 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRF1Q92994 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRF1Q92994 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRF1Q92994 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRF1Q92994 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms