Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EDAQ92838 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EDAQ92838 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EDAQ92838 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDAQ92838 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDAQ92838 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDAQ92838 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDAQ92838 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EDAQ92838 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EDAQ92838 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EDAQ92838 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms