Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC12Q8WUD4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms