Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF3Q8TEJ3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms