Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HELQQ8TDG4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms