Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIEQ8NEW7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms