Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG8Q8ND04 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG8Q8ND04 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms