Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC191Q8NCU4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms