Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACBD4Q8NC06 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms