Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTC29Q8NA56 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms