Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GCSAMQ8N6F7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms