Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms