Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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