Protein–RNA interactions for Protein: Q86UX7

FERMT3, Fermitin family homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT3Q86UX7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FERMT3Q86UX7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FERMT3Q86UX7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms