Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTU1Q7Z7A3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTU1Q7Z7A3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms