Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RUFY3Q7L099 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms