Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSH2Q76I76 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH2Q76I76 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms