Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRINP3Q76B58 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRINP3Q76B58 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms