Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP31Q70CQ4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP31Q70CQ4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
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