Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms