Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms