Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SFTA2Q6UW10 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms