Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms