Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L3Q68CJ9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms