Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CLQ60I27 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms