Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms