Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR78Q5VTH9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms