Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NHSL1Q5SYE7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms