Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms