Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HP1BP3Q5SSJ5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HP1BP3Q5SSJ5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms