Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms