Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODF2Q5BJF6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms