Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL12Q53G59 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms