Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP28Q4G0W2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP28Q4G0W2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms