Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0T1

Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SCART1, humanhuman

Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4G0T1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q4G0T1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q4G0T1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q4G0T1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q4G0T1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Q4G0T1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q4G0T1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q4G0T1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q4G0T1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q4G0T1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q4G0T1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q4G0T1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q4G0T1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q4G0T1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q4G0T1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q4G0T1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q4G0T1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q4G0T1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q4G0T1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q4G0T1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms