Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR1Q2NL82 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms