Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFA9Q16795 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms