Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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