Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SGCAQ16586 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SGCAQ16586 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SGCAQ16586 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SGCAQ16586 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SGCAQ16586 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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SGCAQ16586 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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SGCAQ16586 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SGCAQ16586 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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