Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F4Q16254 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms